Вулкан Бонгапти  — крупный полигенный лавовый вулкан. Диаметр основания вулкана более 10 км, площадь его — около 85 км², объем изверженного материала — 30 км³.
Диаметр вулкана, возможно, был больше, так как отдельные останцы покровов лав встречаются в его окрестностях. Подошва отложений вулкана находится на абсолютной высоте 1300-1400 м. Вулкан представляет собой пологий конус с обширной (3 км) и глубокой кальдерой в центре, фиксирующейся локальным гравитационным минимумом. В кальдере и на склоне вулкана вскрываются отложения фундамента, представленные вулканитами Березовской свиты и алнейской серии. Крутые обрывистые стенки кальдеры имеют высоту 300-400 м. В самом днище кальдеры выделяется куполовидная возвышенность (600х800х(250-300)м), представляющая жерловую интрузию долеритов (Апрелков, Попруженко, 2005).
Склоны вулкана распаханы троговыми долинами. В разрезах вулкана наблюдается чередование однообразных покровов оливин-пироксеновых базальтов мощностью 2-6 м. В верхней части разреза иногда отмечаются отдельные прослои псефитовых туфов с заметно выраженной гравитационной сортировкой. Мощность их достигает 30 м. Общая мощность базальтовых покровов — 250 м. Покровы базальтов вблизи гребня кальдеры имеют довольно крутое (20-25°) падение. Периклинальное залегание лавовых потоков четко устанавливается по замерам на всех склонах вулкана. По гребню и внутренним склонам кальдеры наблюдается прижерловая серия даек базальтов. Дайки являются радиальными, реже встречаются кольцевые и пластовые. Мощность варьирует от 0.25 до 1.5 м. Возраст вулкана древнечетвертичный (Огородов и др., 1972).

Апрелков С.Е., Попруженко С.В. Неоген-четвертичные вулканические образования Камчатки и некоторые проблемы их возраста и образования // Вестник КРАУНЦ. Серия: Науки о Земле. 2005. № 5. С. 145-159.

Огородов Н.В., Кожемяка Н.Н., Важеевская А.А., Огородова А.С. Вулканы и четвертичный вулканизм Срединного хребта Камчатки / Отв. ред. Эрлих Э.Н. М.: Наука. 1972. 191 с.